돌발성 난청환자에서의 중심립주변물질 1 유전자의 단일염기 다형성

Other Titles
Association between Single-nucleotide Polymorphisms (SNPs) of Pericentriolar Material 1 (PCM1) and Sudden Sensorineural Hearing Loss
Authors
한상윤
Issue Date
2014-06
Awarded Date
2014
Abstract
중심립주변물질 1(Pericentriolar material 1, PCM1) 단백은 세포 주기와 연관된 중심소체와 미세소관을 구성하는 것으로 알려져 있다. Corti 기관은 내이의 와우를 구성하는 한 부분으로 유모세포를 가지고 있으며, 외유모세포는 한번 손상을 입게 되면 재생이 되지 않는다. 인체에서 청각과 평형감각의 정보는 액틴을 기반으로 한 부동섬모와 미세소관을 기반으로 한 운동모로 구성된 유모세포의 모속(hair bundle)을 통해 전달이 된다. 본 연구에서는 PCM1 단백 유전자의 단일염기 다형성을 조사하여 돌발성 난청과의 연관성에 대해 알아보고자 하였다. 연구의 대상자는 돌발성 난청 환자 83명과 371명의 대조군으로 하였으며, 대상자의 전혈에서 genomic DNA를 추출하였다. 추출된 DNA 중 PCM1 유전자에서 5개의 exon 구역의 단일염기 다형성을 direct sequencing을 이용하여 연구하였다. 결과는 rs17635381에서 G/G, G/T와 T/T 유전자형의 분포가 대조군에서는 각각 40.9%, 46.9%, 12.3% 로 확인되었고, 돌발성 난청환자에서는 각각 25.3%, 55.7%, 19.0%로 확인되었다. T/T 유전자형은 G/G 유전자형과 비교했을 때 돌발성 난청의 위험을 증가시키는 것으로 볼 수 있었다. rs1847154에서 G/G, A/G와 A/A 유전자형은 대조군에서 각각 25.8%, 50.5%, 23.6%로 분포되고 돌발성 난청환자에서 39.5%, 49.4%, 11.1%로 확인되었다. A/A 유전자형은 G/G 유전자형과 비교했을 때 돌발성 난청의 위험을 감소시키는 것으로 볼 수 있었다. rs370429, rs3780103과 rs74612948의 단일염기 다형성은 돌발성 난청환자와 대조군 간의 어떤 연관도 나타내지 않았다. PCM1 다형성의 haplotype(rs17635381, rs1847154, rs370429, rs3780103과 rs74612948) 중에서는 TGCCA, TGCCG가 돌발성 난청과 연관이 있는 것으로 확인되었다. 결론적으로 이번 연구 결과에서 rs17635381과 rs1847154의 PCM1을 관할하는 두 엑손 구역의 단일염기 다형성이 돌발성 난청의 위험도와 연관이 있는 것으로 생각된다.
PCM1 was identified by virtue of its cell cycle-dependent association with the centrosome complex and microtubules. The organ of Corti contains hair cells, which do not regenerate following damage. Sound is transduced by hair bundles that contain actin-based stereocilia and microtubule-based kinocilia. The present study aimed to investigate whether SNPs in PCM1 are associated with sudden deafness (SD). Eighty-three Korean SD patients were selected from Keimyung University Dongsan Medical Center. The healthy control group consisted of 179 males and 192 females. In rs17635381, the distributions of G/G, G/T, and T/T genotypes in the control group were 40.9%, 46.9%, and 12.3%, respectively, and in SD patients were 25.3%, 55.7%, and 19.0%, respectively. The T/T genotype increased the risk of SD compared with G/G. In rs1847154, the distributions of G/G, A/G, and A/A genotypes in the control group were 25.8%, 50.5%, and 23.6%, respectively, and in SD patients were 39.5%, 49.4%, and 11.1%, respectively. The G/G genotype increased the risk of SD compared with A/A. Among these five haplotypes of PCM1 polymorphisms, TGCCA and TGCCG were associated with SD. These results suggest that the two exon regions rs17635381 and rs1847154 in PCM1 are associated with a risk of SD.
URI
http://kumel.medlib.dsmc.or.kr/handle/2015.oak/11399
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3. 학위논문 > 1. School of Medicine (의과대학) > 석사
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