Association of QRICH2 Gene Polymorphism with Obesity

Other Titles
QRICH2 유전자 다형성과 비만과의 연관성
Authors
손기철
Issue Date
2011-12
Awarded Date
2012
Abstract
Obesity is a well recognized and increasing public health problem in many parts of the world. It is a well recognized risk factor for hypertension, cardiovascular disease, and type 2 diabetes. Obesity is characterized by the activation of an inflammatory process leading to an increase in proinflammatory cytokines and adipokines. Overwhelming evidence indicates that obesity is an inflammatory state caused by chronic activation of the immune system. The human QRICH2 gene is located in a previously identified chromosomal linkage region, 17q25.1. Function of this gene has been unknown, since the QRICH2 gene was found recently. This study aimed to investigate the association of QRICH2 genes polymorphisms with obesity. Case-control association studies were performed. As per the classification of Korean Society for the Study of Obesity (underweight, BMI < 18; normal, BMI 18 to < 23; moderately obesity, BMI 23 to < 25; obesityI, BMI 25 to < 30; obesityII, BMI ≥ 30), normal control (BMI 18 to < 23, n = 220) and overweight/obesity (BMI ≥ 23, n = 257) subjects were recruited. Human genomic DNA was extracted from peripheral blood of subjects and the genotypes of the QRICH2 genes were determined using Illumina Sentrix Array Matrix chips. Statistical analyses were performed using SNPStats, Haploview, HapAnalyzer, SPSS 18.0. Among the three SNPs (rs347675, rs1750927, rs2279053), two SNPs (rs17509527, rs2279053) presented an association with obesity. The rs17509527 SNP was significant in the dominant model (G/G : A/G+A/A) (p = 0.044, OR = 1.49, 95% CI = 1.01-2.21). The rs2279053 SNP was significant in the recessive model (C/C+T/C : T/T) (p = 0.046, OR = 1.67, 95% CI = 1.01-2.76). In haplotype analysis for overweight/obesity and control, the haplotypes did not have significant differences between overweight/obese subjects and the controls. In conclusion this study suggests3 single nucleotide polymorphisms of QRICH2 genes were associated with obesity.
비만은 전 세계적으로 더욱 증가하는 추세에 있으며, 매년 증가하는 중요한 보건 문제로 잘 알려져 있다. 비만은 또한 심혈관계 질환, 고혈압, 제2형 당뇨병의 위험 요인으로 알려져 있다. 비만의 원인으로는 유전적 요인, 환경적요인, 에너지 대사의 이상 등이 있다. 최근 비만은 전 염증상태와 관련되었다고 보고하고 있으며, 비민과 염증 관련 사이토카인의 생물학적 및 유전학적 연구가 활발히 진행되고 있다. 염색체 17q25.1에 위치하는 유전자 Glutamine-rich (QRICH)2는 아직까지 QRICH2 유전자 자체와 코드화한 Glutamine-rich 단백질의 기능과 비만의 관련성에 대한 연구 보고는 없다. 이 연구의 목적은 QRICH2 유전자 다형성과 비만과의 연관성을 알아보기 위해 환자-대조군 연구를 시행 하였다. 대상자는 과체중과 비만군은 257명, 정상군은 220명이며, 체질량지수 23이상 25미만을 과체중, 25이상을 비만, 18에서 22.9를 정상으로 구분하였다. 대상자의 말초혈액에서 genomic DNA를 추출하였으며, Affymetrix chip을 이용하여 QRICH2의 유전자형을 분석하였다. 통계적인 분석은 SNPStats, Haploview, HapAnalyzer, SPSS 18.0 프로그램을 이용하였다. QRICH2 유전자의 단일염기다형성 3개 (rs2279053, rs347675 및 rs17509527)에 대해서 분석을 하였으며, rs2279053, rs17509527에서 의미 있는 차이를 보였다 (rs2279053: p = 0.046, OR = 1.67, 95% CI = 1.01-2.76 열성모델 결과, rs17509527: p = 0.044, OR = 1.49, 95% CI = 1.01-2.76 우성모델 결과). 또한 3개 (rs2279053, rs347675 및 rs17509527)의 단일염기다형성에서 유의한 haplotype은 없었다. 이 연구의 결과는 QRICH2 유전자의 다형성이 한국인의 비만과 관련이 있음을 제시한다.
URI
http://kumel.medlib.dsmc.or.kr/handle/2015.oak/11552
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3. Thesis (학위논문) > 1. School of Medicine (의과대학) > 석사
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