돌발성 난청환자에서의 CACNA1E 유전자의 단일염기 다형성

Abstract

CACNA1E(Calcium Voltage-Gated Channel Subunit Alpha 1E) is protein coding gene. Bending of Stereocillia of outer hair cell makes depolarization and voltage-gated calcium channel opens. Calcium ion causes the release of neurotransmitter stimulation. The present study aimed to investigate whether single nucleotide polymorphisms (SNPs) in CACNA1E are associated with sudden deafness (SD). Eighty-one Korean SD patients and 455 healthy control group were selected from Keimyung University Dongsan Medical Center. Human genomic DNA was extracted from peripheral blood samples and five exon region SNPs in CACNA1E were genotyped by direct sequencing. In rs357737760, the A/T genotype increased the risk of SD compared with T/T (p=0.0003). In rs34488539, the C/T genotype increased the risk of SD compared with C/C (p=0.0003). In rs4652678, the C/T genotype increased the risk of SD compared with T/T (codominant model, p=0.0079) (dominant model, p=0.0027) (overdominant model, p=0.0021). In rs199930, the C/T genotype increased the risk of SD compared with C/C (codominant model, p=0.0081) (dominant model, p=0.0028) (overdominant model, p=0.0022). In rs704326, the A/A genotype decreased the risk of SD compared with G/G (codominant model, p=0.0003) (recessive model, p=0.0001). These results suggest that the four exon regions, rs35737760, rs344488539, rs4652678 and rs199930 in CACNA1E are associated with a risk of SD. And also these results suggest that the one exon regions, rs704326 in CACNA1E are associated with a risk of SD.

CACNA1E 유전자는 Calcium Voltage-Gated Channel subunit Alpha 1E 단백질을 암호화한다. 와우의 유모세포 부동섬모가 구부러지며 발생한 세포 내 탈분극은 전압의존성 칼슘 이온채널을 작동시킨다. 이를 통해 신경전달 물질이 방출된다. 본 연구에서는 CACNA1E 유전자의 단일염기 다형성을 조사하여 돌발성 난청과의 연관성에 대하여 알아보고자 한다. 연구의 대상자는 돌발성 난청 환자 81명과 정상대조군 455명을 대상으로 하였으며, 대상자의 전혈에서 genomic DNA를 추출하였다. 이 중 CACNA1E 유전자 중 5개의 구역의 단일염기 다형성을 direct sequencing을 이용하여 연구하였다. 결과는 rs35737760에서 AT 유전자형이 TT 유전자형에 비교하였을 때 돌발성 난청의 위험을 증가시키는 것으로 볼 수 있었다(p=0.0003). rs34488539에서는 CT 유전자형이 CC 유전자형과 비교하였을 때 돌발성 난청의 위험을 증가시키는 것으로 볼 수 있었다(p=0.0003). rs4652678에서는 CT 유전자형이 TT 유전자형과 비교하였을 때 돌발성 난청의 위험을 증가시키는 것으로 볼 수 있었다(codominant model, p=0.0079) (dominant model, p=0.0027) (overdominant model, p=0.0021). rs199930에서는 CT 유전자형이 CC 유전자형과 비교하였을 때 돌발성 난청의 위험성을 증가시키는 것으로 볼 수 있었다(codominant model, p=0.0081) (dominant model, p=0.0028) (overdominant model, p=0.0022). rs704326에서는 AA 유전자형이 GG 유전자형에 비교하였을 때 돌발성 난청의 위험을 감소시키는 것으로 볼 수 있었다(codominant model, p=0.0003) (recessive model, p=0.0001). 결과적으로 CACNA1E의 다섯 개의 엑손 구역의 단일염기 다형성이 돌발성 난청의 위험성과 관련이 있는 것으로 생각된다.